Ο Σωτήριος Π. Πατσιλινάκος γεννήθηκε στην Καλλιθέα, Αθήνα και είναι έγγαμος με δύο παιδιά. Ολοκλήρωσε τις βασικές του σπουδές στο Λύκειο Κολλεγίου Αθηνών το 1983. Μιλά ελληνικά και αγγλικά. Είναι απόφοιτος της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών, απ’ όπου αποφοίτησε τον Ιούλιο του 1989 με βαθμό «Λίαν Καλώς». Στη συνέχεια, ειδικεύτηκε στην Καρδιολογία, λαμβάνοντας την ειδικότητα στις 2 Φεβρουαρίου 1998 στο Νοσοκομείο «Ευαγγελισμός». Ειδικεύεται στην Επεμβατική Καρδιολογία.

Από το 1999 έως το 2008 εργάστηκε στο Νοσοκομείο «Κωνσταντοπούλειο» ως Επιμελητής Β΄ και Α΄ του Καρδιολογικού Τμήματος. Από το 2009 είναι Συντονιστής Διευθυντής του ίδιου τμήματος. Η επεμβατική του δραστηριότητα περιλαμβάνει ετησίως 1.200-1.400 στεφανιογραφίες, 400-500 αγγειοπλαστικές, καθώς και 100-120 εμφυτεύσεις βηματοδοτών. Τα τελευταία πέντε χρόνια έχει εξειδικευτεί στις χρόνιες ολικές αποφράξεις, πραγματοποιώντας 45-60 περιστατικά ετησίως.

Το 2003 απέκτησε διδακτορικό δίπλωμα από την Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Αθηνών, με βαθμό «Άριστα». Έχει 111 δημοσιεύσεις σε διεθνή περιοδικά καταχωρημένα στο PubMed, εκ των οποίων αρκετές αφορούν πολυκεντρικές μελέτες, και 56 δημοσιεύσεις σε ελληνικά περιοδικά. Έχει παρουσιάσει 156 ανακοινώσεις σε διεθνή συνέδρια και 265 σε ελληνικά.

Η συγγραφική του δραστηριότητα περιλαμβάνει τη συγγραφή κεφαλαίων σε πέντε βιβλία και τη μετάφραση ενός βιβλίου. Έχει συμμετάσχει ως ομιλητής σε περισσότερα από 100 συνέδρια και ως εκπαιδευτής σε πλήθος σεμιναρίων και εκπαιδευτικών προγραμμάτων. Είναι ενεργό μέλος σε τουλάχιστον 35 πολυκεντρικές μελέτες, στις περισσότερες ως κύριος ερευνητής, και έχει παρακολουθήσει πάνω από 100 συνέδρια.